呈色反応モデル画像の数値化をImageJのマクロで自動化〜自宅でできる簡単な研究(FR-1.4)

何かの役には立たないし、人から見たらどうでも良いことで自己満足の世界でありますが、デンプンやタンパク質を測定する実験の構想で述べた考えをもとに個人研究として取り組んでいます。

目次
　1. マクロにするマニュアル操作の概要
　2. Record機能を用いてマクロの作成
　3. “List" “Data" ボタン操作のマクロ
　4. 参考情報

　(1) Edit >> Copyメニューで解析領域をコピー
　(2) File >> New >> Internal Clipboardメニューで解析領域をペースト
　(3) Image >> Split Channelsを実行
　　　"red","green","blue"のチャンネルに色分解される
　　　一番上に表示されているアクティブな"blue"のチャンネルの画像を解析する
　(4) Edit >> Invertで色分解されたの画像を反転
　(5) Edit >> Selection >> Select Allで選択
　(6) Analyze >> plot Profileを実行
　(7) 解析データーをCSVファイルに名前をつけて保存
　(8) 解析を終了した"blue"のチャンネルのProfileと画像を閉じる　

run(“Clear Results");
Plot.getValues(x, y);
for (i=0; i<x.length; i++){
setResult(“X", i, x[i]);
setResult(“Y", i, y[i]);
}
saveAs(“Results", “/Users/ABC/Desktop/Blue_m_.csv");

run(“Copy");
run(“Internal Clipboard");
run(“Split Channels");

run(“Invert");
run(“Select All");
run(“Plot Profile");

run(“Clear Results");
Plot.getValues(x, y);
for (i=0; i<x.length; i++){
setResult(“X", i, x[i]);
setResult(“Y", i, y[i]);
}
saveAs(“Results", “/Users/ABC/Desktop/Blue_m_.csv");

close();
close();

run(“Copy");
run(“Internal Clipboard");
run(“Split Channels");
run(“Invert");
run(“Select All");
run(“Plot Profile");
run(“Clear Results");
Plot.getValues(x, y);
for (i=0; i<x.length; i++){
setResult(“X", i, x[i]);
setResult(“Y", i, y[i]);
}
saveAs(“Results", “/Users/ABC/Desktop/Blue_m_.csv");
close();
close();

run(“Invert");
run(“Select All");
run(“Plot Profile");
run(“Clear Results");
Plot.getValues(x, y);
for (i=0; i<x.length; i++){
setResult(“X", i, x[i]);
setResult(“Y", i, y[i]);
}
saveAs(“Results", “/Users/ABC/Desktop/Green_m_.csv");
close();
close();

run(“Invert");
run(“Select All");
run(“Plot Profile");
run(“Clear Results");
Plot.getValues(x, y);
for (i=0; i<x.length; i++){
setResult(“X", i, x[i]);
setResult(“Y", i, y[i]);
}
saveAs(“Results", “//Users/ABC/Desktop/Red_m_.csv");
close();
close();